为严密统治遂川人民，肖家璧推行自己创意的保甲制度，将国民党政府制定的《保甲制度》规定的区以下设联保、保甲，改为各乡设保甲，各级之间环环相扣，互相牵制。1934年1月，肖家璧编印了《遂川大坑保甲实验录》，其做法得到了蒋介石、何应钦的通电嘉奖。在军事方面，肖家璧于大坑、西溪、堆前、草林、大汾等地，修筑大小碉堡150余座，在遂川县城建有弹药库、监狱、水牢等。在扩充军事势力的同时，进行经济掠夺，垄断了全县了油行和粮库，对民众任意派捐派款，敲诈勒索。

　　1949年5月，随着人民解放军渡过长江，以迅猛之势扫击江南，国民党江西省政府推出肖家璧在赣西对抗解放军，任命他为“井冈绥靖区第一纵队少将司令”，拨给一批枪弹。肖家璧虽然知道国民党大势已去，仍然鼓起反革命雄心，妄图凭借遂川山区的险要地形，与解放军周旋，负隅顽抗。肖匪派人到处造谣，说“解放军来了，又要实行共产共妻，小孩运到东北去，女人集中劳军”，并在各种会议上猖狂叫嚣“解放军有千军万马，我肖司令有千山万岭，共产党能打游击，我们为何不能？”

　　就在这时候，另一个遂川人陈正人，被中央任命为中共江西省委书记兼江西军区政委。1949年5月中旬，陈正人奉命来到北京，在香山由毛泽东主席召见。毛泽东对江西的工作作了详细指示后，忽然把话一转：“正人，你回到江西后，注意给我找一个人。”“找谁呀？”“这人我要找，你也要找。他不是别人，还是你的同乡，他是革命的死敌，也是我的死敌。”陈正人一听马上反应过来：“唉，我知道了，他是肖家璧。主席放心，我们一定要抓到他。”毛泽东点首又道：“该给他算总账了，在井冈山的时候，我们没有抓到他，让他苟活了20多年。”陈正人听后坚定回答：“现在不能让他再跑了。”

　　6月上旬，陈正人与邵式平、陈奇涵等人率领一批南下干部来到江西南昌，组建了省委、省军区。7月上旬，陈正人主持了省军区与解放军第48军联席会议，研究对赣西、赣南的剿匪斗争，会议决定该军142师挺进赣西。

　　1949年8月2日，142师解放遂川全县，留下425团专门剿击肖家璧土匪。该团与遂川县人民政府研究了清剿肖匪的作战方案，成立清剿指挥部，绘制了大坑一带的地图，翻拍肖家璧的照片，发给参战的解放军和民兵。

　　在人民解放军的强大攻势下，肖家璧的千余土匪武装土崩瓦解，有的被消灭，有的向解放军投诚。肖匪见大势已去，带着百余心腹人员逃入仙人迹、石公坑一带的深山老林。9月22日，解放军得到群众提供的情报：肖家璧只带少数亲信流窜到樟木坑、犁壁山，425团即派出5个战斗组追踪围捕。犁壁山一带山高路险，树木郁深，藏在野猪棚的肖家璧躲过围捕，但他的贴身保镖刘尚焕被解放军抓住。425团根据刘的口供，从25日起增派搜索部队，日夜进行搜剿，不放过一处草丛和一座崖洞。28日拂晓，副班长赵文珍带人搜索到湖坑西山时，发现有人向山下草丛跑去，指挥战士们包抄过去。因为上级严令活捉肖家璧，战士们只有朝天鸣枪。赵文珍发现前头齐腰深的草丛中有人影晃动，猛扑过去，一把抓住那人，稍一辨认此人就是肖家璧。

　　杀人不眨眼的反革命“屠夫”肖家璧，终于落到了人民的手里。1949年11月11日，4万余群众从井冈山区方圆百里的村村寨寨走出来，汇集在遂川水南中学操场，参加公审肖家璧的宣判大会。50余名群众代表登台讲话，用血泪斑斑的事实控诉肖匪的滔天罪行。遂川县人民政府根据广大群众的强烈要求，宣判肖家璧死刑，当即执行。

　　是日晚上，江西省委书记给北京发去了这样的电报：“毛主席：人民死敌肖家璧已于今日公审处决，井冈民众人心大快。”