1979年6月21日，一份马寅初家属要求为马寅初落实政策的报告，送到了中南海，送到了党中央副主席陈云的案头。陈云仔细阅读了报告的全文，当天在这份报告上作了如下指示：耀邦同志：马寅初的问题，应该平反，如何请酌。

报告送到胡耀邦那里，他即在陈云批示之后，又写下了一段批示：任穷同志：请即同统战部商量，我赞成恢复他的名誉。

胡耀邦的批示当即以急件送到中央组织部，宋任穷看到陈云、胡耀邦在同一天为同一份材料进行的批示，可见此件非同小可，于是也立即给中央统战部作出批示，要求尽快解决。

在陈云、胡耀邦等中央领导同志的亲切关怀下，中共中央开始为马寅初落实政策。1979年秋，中共中央充分肯定了马寅初的《新人口论》和综合平衡的经济理论都是正确的，推翻了强加于马寅初头上的一切不实之辞，彻底平反恢复名誉，并任命马寅初为北京大学名誉校长。