周恩来让习仲勋研究后向他汇报。习仲勋看了《七万言书》，认为虽有一些激烈的言词，但大部分意见和建议是好的。周恩来又委托习仲勋去看望第十世班禅额尔德尼。习仲勋充分肯定了他敢于向党中央直言不讳提意见的可贵精神，同时劝他不要动气，不要说气话。第十世班禅额尔德尼对习仲勋说：“你讲的我接受。你看着我长大，从一开始就帮助我，你是代表党的，作为个人又是朋友，你是为我好，我今后注意就是了，但我说明，我是真心为党好的。”

    后来，周恩来亲自接见了第十世班禅额尔德尼。周恩来充分肯定了他的意见，并说：“执行民族政策不够好的现象是可以很快解决的，要相信党中央的方针、政策一定会贯彻下去的。遇到民族问题，正确的态度是和当地党政领导交谈，也可以向中央反映，共同协商，把问题尽快妥善解决。”第十世班禅额尔德尼对此表示同意和拥护。

    6月上旬，第十世班禅额尔德尼把《七万言书》报送中央。中央和国务院十分重视，责成李维汉、习仲勋召集有关方面负责人讨论研究，提出改进西藏工作的意见，最终形成了纠“左”防急4个文件，报经国务院批准。

    8月13日至9月2日，西藏工委召开第6次扩大会议，传达了周恩来、李维汉等人对西藏工作的指示，大家基本上统一了认识，明确了方向。第十世班禅额尔德尼也感到高兴，认为西藏工作会开创了一个新的局面。

    9月24日至27日，中央八届十中全会召开。在会上，李维汉被批评为不抓民族问题上的阶级斗争，向第十世班禅额尔德尼和喜饶嘉措等人妥协退让、一味迁就，搞投降主义；认为习仲勋在《七万言书》问题上采取了迁就、放任的态度。自此以后，习仲勋被解除了职务，接受审查。第十世班禅额尔德尼和喜饶嘉措等也都不断地受到批判。直到党的十一届三中全会以后，他们两人在错案先后得到彻底平反后才得以再次见面。

    老友重逢，感慨万端。第十世班禅额尔德尼对习仲勋说：“因为我的《七万言书》把你给连累了，真对不起。”

    习仲勋说：“这不是谁连累谁的问题，我们都受到了锻炼和考验，增长了见识，党对你是了解的。”

    1980年底，习仲勋从广东调到中央工作，分管民族、宗教、统战工作，与第十世班禅额尔德尼的关系越来越密切，友谊越来越深厚。每当第十世班禅额尔德尼视察、出国和进行重大活动时，习仲勋总是劝告他：一要注意身体；二遇事要冷静，不要动气。第十世班禅额尔德尼每次外出回来后，也总是找习仲勋谈心，无话不说。

    1982年3月11日，第十世班禅额尔德尼给习仲勋和胡耀邦写信，提出想在适当的时候到甘肃、四川、云南和西藏的一些地方进行视察访问。习仲勋看了这封信后当即转呈胡耀邦阅示。次日，胡耀邦作了批示：“每年出去视察参观一二次，这个办法好。其他党外朋友凡身体好的，都可以鼓励和赞助他们这么办。班禅今年外出视察，请仲勋、兰夫、彭冲同志商定。我的考虑是：这两年以去他没有去过的地方为主。我们的国家很大，到处走走，很能增长见识。见识多了，对考虑国家大事就会更成熟。这也是我们培养和扶助党外朋友的一个好办法。当然，到完全生疏的地方去，发言权就小一点，而要多观察、多调查、多学习，但也不是不可以发表意见。看准了、想清楚了就说就提，这也是一种锻炼。如果班禅觉得不去一下藏族地区不好，那么，去一两个这样的地方，我也不反对。”

    这年夏天，第十世班禅额尔德尼终于如愿以偿地到西藏进行了视察访问。7月10日，他在拉萨干部大会上说：“我从幼年起一直是在共产党和老一辈无产阶级革命家毛泽东主席、周恩来总理、刘少奇主席、朱德委员长、陈毅元帅、贺龙元帅等教育、培养和关怀下长大成人的。我对党、对老一辈无产阶级革命家怀有特殊深厚的感情。30年来，我遵照党的教导，在主观上总是要求自己对西藏的革命和建设事业、对加强汉藏民族的兄弟情谊、对维护祖国的统一做一些有益的事情。”

    在离开西藏前，第十世班禅额尔德尼同西藏自治区党委交换了意见，对干部和宗教问题谈了自己的看法。新华社记者对此作了报道，习仲勋阅后批示：“西藏问题的关键是达赖、班禅问题，也就是一个宗教问题。而在今天又是对达赖、班禅这两个精神领袖的基本认识问题。对这两个人的态度确定了，依此才可作出对西藏地区的政策和方针。否则，我们就会思想混乱、方针不明确，因而引起政策矛盾，在工作中发生失误。”

    1989年12月28日凌晨，第十世班禅额尔德尼在西藏主持灵塔开光典礼，因心脏病突发，抢救无效，英年早逝。噩耗传来，习仲勋十分震惊，万分悲痛。2月20日，他在《人民日报》撰文深切悼念这位中国共产党的忠诚朋友。